وقال ايمن الظواهري في تسجيل صوتي نشر على مواقع الكترونية معتمدة لدى تنظيم القاعدة ، إن " زعيم الدولة الاسلامية في العراق والشام ابو بكر البغدادي يعتبر مرتد عن مله الاسلام بعد ان اسس له خلافة دون الرجوع الى زعماء الاسلام الحقيقين في اشارة منه الى نفسه أي الظواهري ، وخرج عن طاعة الخليفة المنصب من قبل سلفه " أي تنصيب الظواهري بعد اسامة بن لادن " وبين الظواهري ان الاسلام برئ من البغدادي لما يقوم به من تصرفات خارج علم المسلمين ، وبين الظواهري ان الكلمة التي تطلقها الدولة الاسلامية "باقية وتتمدد" بانها كلمة كفر لاننا نحن في حياة فانية لايبقى بها الا وجه الله فهذه من اكبر الاخطاء التي يرتكبها البغدادي وتعد كفر بامر الله تعالى .
واضاف الظواهري أن "أهل الجهاد وخاصة الدولة الاسلامية بقيادة البغدادي اساءوا الى مسمى الجهاد لدوافع شخصية داعيا تنظيم القاعدة في الوقت ذاته "الى مواصلة قتال الدولة الاسلامية وعدم الانصياع الى انتصاراتها لانها بالنهاية سوف تزول ويبقى تنظيم القاعدة لانه الاسلام الحقيقي حسب قوله .
ويذكر ان خلاف كبير وقع في سوريا بين تنظيم القاعدة المتمثل بجبه النصرة وبين الدولة الاسلامية في العراق والشام بعد ان رفضت النصرة الاندماج الى الدولة الاسلامية تحت قيادة البغدادي .